Сокрушив республиканский аванпост, Гривус с Вентресс приступают к вынашиванию плана атаки на республиканские фабрики по созданию клонов. Тем временем, Энакину с Оби-Ваном удаётся перехватить закодированное послание генерала, благодаря которым они раскрывают коварный замысел неприятеля. Целью преступников становится уничтожение ДНК прототипа клонов, без которой дальнейшее производство солдатов окажется невозможным. Вчерашняя команда бойцов-клонов возвращается на планету, чтобы защитить родину от вторжения неприятеля, пусть даже ценой собственной жизни.