Carl Brantley, riceve un duro colpo alla carriera e la stampa ci va a nozze, Mac tuttavia decide di sostenere l'amico e di nominarlo come prossimo candidato alla carica di Procuratore Generale. Un aereo militare che trasporta armi sparisce mentre sta sorvolando il Pakistan e il Vice Presidente Keaton prende in mano le redini della situazione. Nel frattempo Rod cerca di assestare la vita domestica nella routine quotidiana, ma Kate scompare, lasciando Rod nel bel mezzo di una crisi.